С 1 января 2015 вступил в силу Договор о Евразийском экономическом союзе от 29 мая 2014 года (далее Договор). Киргизия присоединилась к данному Договору с 12 августа 2015года. На основании положений Договора не имеет значения, на какой срок был заключен трудовой договор с гражданином Кыргызстана и был ли он прекращен ранее 183 дней. В любом случае трудовые доходы с данным работником облагаются НДФЛ с первого дня выплаты заработной платы  по общей с российскими резидентами ставке 13%. Указанная норма действует начиная с первого дня работы граждан ЕАЭС на территории РФ. Речь идет о работах по трудовым договорам, договорам подряда и возмездного оказания услуг, которые выполняются на территории России.

При этом положения Договора о ЕАЭС о применении к доходам граждан этих государств налоговых ставок, предусмотренных для налоговых резидентов государств-членов, не означает, что указанные граждане автоматически признаются резидентами в соответствующем государстве. Вопросы признания физического лица налоговым резидентом какого-либо из государств-членов Договором о ЕАЭС не регулируются. В этих целях используются положения налогового кодекса РФ.

Поэтому если по итогам налогового периода (года) работник – гражданин Кыргызстана не имеет статуса налогового резидента (находились в РФ менее 183 дней в течение 12 следующих подряд месяцев), его доходы, полученные в данном налоговом периоде, подлежат обложению НДФЛ по ставке 30%. Доходы сотрудников, по итогам налогового периода признаваемых налоговыми резидентами РФ, подлежат обложению по ставке в размере 13 процентов и не пересчитываются.