Если первую часть зарплаты (аванс) организация выплачивает в последний день месяца, то с нее тоже нужно удержать НДФЛ. Исчисление сумм НДФЛ производится налоговым агентом в последний день месяца, за который работнику был начислен доход в виде оплаты труда. Обычно аванс выплачивают в середине или начале месяца, а в конце зарплата.

В таком случае с аванса НДФЛ не удерживают. Однако в организациях, где аванс выплачивают 30-го числа текущего месяца, а вторую часть зарплаты – 15-го числа следующего месяца, НДФЛ нужно исчислить и с аванса тоже. То есть НДФЛ нужно исчислить и при выплате первой части зарплаты в последний день месяца (30 числа), и при выплате второй части зарплаты (15 числа). Определение Верховного суда РФ от 19 февраля 2020 года № 305-ЭС19-27749.

Бухгалтерия.ру